La Saarland University collabora con l’organizzazione cinese di genomica BGI

L’azienda cinese BGI e Saarland University hanno annunciato una partnership strategica. “L’obiettivo non è solo quello di esplorare il ruolo degli RNA non codificanti nelle malattie neurodegenerative come l’Alzheimer e il Parkinson. Miriamo anche a una comprensione più generale: qual è l’impatto dei piccoli RNA nell’invecchiamento? E come possiamo applicare le nostre conoscenze sugli RNA non codificanti per facilitare l’invecchiamento in modo più sano? “, Spiega il professor Andreas Keller, portavoce del Centro di bioinformatica dell’Università della Saarland che detiene anche la cattedra di Bioinformatica clinica.
Nella cooperazione, BGI fornirà le conoscenze approfondite sul sequenziamento high-throughput. “Dal punto di vista tecnico, i dispositivi sviluppati da BGI sono perfettamente adatti per questo compito, perché non si basano sull’amplificazione mediante la reazione a catena della polimerasi, la replica ripetuta di un segmento di DNA focalizzato”, come Keller spiega uno dei vantaggi del BGISEQ tecnologia sviluppata dall’organizzazione cinese. Mentre il sequenziamento è attualmente eseguito presso le strutture BGI, i partner stanno allestendo un laboratorio di sequenziamento presso la Saarland University. Insieme, la BGI e la Saarland University sequenziano il repertorio di RNA non codificanti nelle cellule del sangue, nel siero, nel plasma e parzialmente anche in campioni di tessuto di centinaia di pazienti e controlli in Europa e Cina. Le analisi computazionali delle centinaia di terabyte di dati saranno eseguite utilizzando software e database all’avanguardia sviluppati dal gruppo di Keller, adattati per la ricerca su frammenti di RNA non codificanti. Con “miRCarta” e “miRMaster”, Keller ei suoi colleghi hanno già sviluppato potenti soluzioni per l’analisi dell’RNA non codificante che vengono utilizzate dai ricercatori di tutto il mondo. In primo luogo, i ricercatori sperano di fornire nuovi strumenti diagnostici per la diagnosi precoce della malattia di Alzheimer. Inoltre, la BGI e la Saarland University esploreranno congiuntamente il potenziale degli approcci di deep learning per interpretare i profili molecolari complessi e combinarli con altri dati, ad es. dai dispositivi di imaging.
La partnership si allinea perfettamente con la strategia per esplorare gli RNA non codificanti nella neurodegenerazione e nell’invecchiamento, secondo Keller. La Saarland University sta già effettuando ricerche su piccoli RNA non codificanti (microRNA) nella malattia di Parkinson. In un progetto congiunto con il Prof. Rejko Krüger del Center for Systems Biomedicine del Lussemburgo, il team di ricerca internazionale spenderà oltre 2 milioni di dollari per analizzare i profili miRNA dei pazienti e dei controlli di Parkinson, per monitorare lo stato dei pazienti nel tempo e sviluppare nuove strategie terapeutiche. Parkinson è anche noto per aver influenzato l’attore americano Michael J. Fox, che ha recitato nel film “Ritorno al futuro”. La Michael J. Fox Foundation, il più grande finanziatore non profit della ricerca sulla malattia di Parkinson nel mondo, sostiene gli scienziati di Saarbrücken in questo sforzo. Inoltre, i ricercatori della Saarland University ricevono anche finanziamenti dalla fondazione Michael J. Fox per comprendere l’influenza della terapia della malattia di Parkinson sul microbioma intestinale dei pazienti. Questo progetto, sottolinea Keller, è anche facilitato dall’equipaggiamento tecnico di BGI. Lui ei suoi colleghi sono convinti che la tecnologia di BGI rafforzerà in modo significativo l’infrastruttura di ricerca genetica dell’Università della Saarland.
La Saarland University ha una forte cultura di ricerca a livello mondiale sul microRNA e sull’invecchiamento. BGI lavorerà a stretto contatto con gli scienziati del Saarland sulla base della piattaforma BGISEQ e l’analisi dei Big Data per una migliore comprensione dell’invecchiamento e spera di generare prognosi migliori per l’Alzheimer e altri disturbi neurodegenerativi. Inoltre, la collaborazione andrà sempre più in profondità sul fitness associato a microRNA, sullo sviluppo di farmaci di precisione e sulla cura del paziente.
“All’interno di questa era di Cina e Germania che dà forma all’innovazione insieme, BGI è felice di rafforzare la partnership innovativa con università, istituti e aziende tedesche, al fine di costruire conoscenza e valore e promuovere l’innovazione scientifica e l’efficienza del settore!” Afferma il capo di BGI Responsabile dello sviluppo Ning Li.